海难发生后不久，中央政府驻香港联络办公室（中联办）副主任李刚跟香港特首梁振英一同前往医院探望伤者时，声言会帮助特区政府处理海难。
李刚说：“我们对这次出现的海难、死亡的市民表示沉重的哀悼和慰问，我们中联办对此非常关心，现在正在和内地的有关部门联系，跟广东省联系，立即在最短的时间内，能够调遣打捞船帮助特区政府来抢救生还的市民。”
突如其来的撞船事故发生在10月1号晚上8点，到星期二下午，当局已经确认37人死亡。据报道，次日10月2号凌晨，中国交通部南海救助局收到广东省政府的通知，要求调派资源到香港。随后，大陆当局派出四艘救援船艇和一个应急反应救助小分队，于早上4点抵达香港，在香港水警的指挥下，准备参与撞船事故的搜索和救援工作。
美国之音已致电香港政府新闻处查询特首是否主动向中联办提出求助，还是中联办主动要求介入救援工作。新闻处答复，特区政府会在下午的新闻发布会上做出说明。
在随后的新闻发布会上，特首梁振英证实有多艘大陆船只早晨抵达发生海难的香港附近水域，待命在香港当局的指挥下加入救援工作。他没有正面回答特区政府是否主动向中央请求援助，但强调人命关天，香港需要调动所有能够调动的支援力量。他又说，在实际救援工作中特区政府得知本地的资源足够应对这起事件，因此没有动用大陆船只，之后大陆船只离开了香港水域。
香港一些民众对中联办参与救援工作表示反感，质疑处理事故是否需要请外援，认为事件是香港内部事务，跟中联办和广东省没有关系。有网民直指“梁振英妙用惨剧第一时间借机强化中联办的地位”，也有网民认为，如果香港特首不是有意让中联办干预内政的话，作为政治家他应该懂得避嫌，先让香港海事部门向特首提出建议，才出面向中央求助。有香港的电台主持人更批评中联办高调亮相，令中央官员凌驾于特区政府之上，破坏一国两制。
近年中联办一直被指干预香港内部事物，令港人密切地关注中联办的一举一动。
