但有学者批评这样等同干预学术自由，著名自由派学者吴稼祥在微博更批评说：“这不是社科院，是猪圈。极左黑帮又在玩八十年代的罪恶游戏。”

中国社科院由去年年底起，加强对干部的马克思主义教育。副院长赵胜轩又对内地传媒表示，把政治纪律作为首要考核因素，在课题立项、干部选拔和经费资助等日常管理中，严格实施政治责任考核，一票否决制。另一方面，又把政治素质、行为表现和意识形态，作为考核领导干部的重要内容，凡品行、作风不正或出现政治违纪问题的，一律不予任用或免职。

人民日报文章还透露，近年来，在社科院党组领导下，社科院科研人员通过写文章、著书、讲课及接受媒体访谈，开设微博、博客等方式，对西方宪政民主、普世价值、公民社会等错误思潮进行辨析和批驳，帮助广大群众和全社会分清是非，消除错误思潮的影响。

吴稼祥除了在微博上怒斥社科院这个做法等同是“猪圈”，他在接受德国之声的访问时表示，这还牵涉中共党内派系斗争。他说，目前党内斗争异常激烈，这是社科院设计陷害习近平为首的改革派，让改革派背上“走资产阶级自由化”的罪名。

社科院在年初成立马克思主义学院，院方表示目的是要巩固马克思主义阵地，近年他们更组织研究人员，对西方宪政民主、普世价值等思潮进行批驳，表示要帮助社会分清是非，消除错误思潮的影响。