香港销路最大的两份报章24日不约而同的引述消息指出，当局在温州高铁意外现场挖一巨坑埋葬出事车厢的残骸，怀疑是企图湮灭事故真相之举。《苹果日报》的头版标题是“隐瞒真相”，而《东方日报》的标题则是“狂挖巨坑掩埋真相？”，不约而同的怀疑当局有湮灭证据的意图。
《东方日报》指出，高铁事故发生后仅十二小时，桥下现场24日早突然开来多辆挖泥机，短时间内挖出一个巨坑。报道引述目击者称，当局派出工程车把列车车厢切割后，再把碎片辗压、推入大坑掩埋，引起当局意图掩埋真相疑云。铁路部门虽然解释是为了腾出地点，让大吨位的大吊车开入，惟愈描愈黑，引起网民质疑。
而《苹果日报》的报道指出，该报记者在出事现场看到数百米外仍有大批民众眺望当局在现场抢救，特别是当看到挖掘机就地挖坑，将锯开的火车的残骸推入坑中填埋时，观看的民众不禁发出譁然，质疑铁路部门是“毁灭证据”。有人更说：“看哪，他们在掩埋出事证据！”
根据报道，现场参与救援的村民表示，他们23日晚通宵协助救援人员抬人搬杂物，到了24日白天，铁路部门突然派来近十辆掘泥机。“我们也不知道要挖坑干什么，反正按命令办事就是了”。有掘泥机司机坦言，有关部门要求该土坑一定要够大够深，结果他们挖了一个数十米大的巨坑。
由于现场戒备森严，记者从远处高位望过去，可见桥下菜地里，掘泥机挖出的泥土已经堆出一座小山，可见巨坑之大。随后工程人员将堕桥车厢碎件推入坑内，随后更切割车厢，辗压推入大坑。有关消息在网上曝光后，网民议论纷纷，质疑违反《事故应急救援》中不得破坏事故现场及毁灭证据的规定。
负责现场清理的中铁三局人士解释，要将桥上出轨的车厢吊下桥，需用三百吨级的大吊车，为腾出空间让吊车进场，才如此处理。但网民直指当局大话连篇，因为现场有足够的位置让大吊车进入，挖坑动机不良。
有现场群众怀疑当局对被撞断跌落桥的车厢，并未拖回去化验、检查，而是出动重型挖掘机，当场砸毁、挖坑掩埋，纷纷向记者们发出疑问：“车厢里面会不会还有人？”“旅客的行李怎么都不管了？”
根据官方的数字，两列和谐号高铁发生追撞的意外，一共造成35人死亡，192人受伤。据报道，肇事两列动车，都是中国的仿制品，分别载有 58和1072乘客。其中，D3115动车是川崎重工－南车四方生产的CRH2型，原型为日本新干线；D301动车是庞巴迪－南车四方的CRH1型。这是自2007年国产动车上线营运以来最严重事故，对近期备受质疑的内地铁路建设的辉煌成果，特别是高铁运动，又是一大打击。
