据印度媒体《第一邮报》（First Post）报道，中巴签署的水利合作备忘录包括在印度河上游、巴控克什米尔境内修建迪阿莫—巴沙（Diamer-Bhasha）和邦基（Bunji）两座水电站。这两座超大型水电站的设计产能分别为4500兆瓦和7100兆瓦，预计总成本为270亿美元，被视为“一带一路”倡议下中巴经济走廊的延伸项目。
《第一邮报》引述了印度环保人士、水利专家、中国问题专家等人的观点，表达了印度方面对这两座水电站的担忧，这些顾虑主要集中在修建水电站对生态环境影响、对居民生活影响、中国军队可能进驻当地对克什米尔政局产生的影响、以及印度对克什米尔地区的主权等方面。2015年，中国在巴控克什米尔地区开始修建一座1100兆瓦的水电站 —- 科哈拉（Kohala）水电站时，印度曾表达过类似的担忧和抗议。
实际上，印度对巴基斯坦在克什米尔地区修建水电站的抗议并非单纯针对中国的一带一路项目，其背后是长达几十年的印巴水资源控制权之争，而近来的发展显示，中国将会不可避免地被拖入这场“战争”当中。
印巴水资源之争
印度河发源于中国境内的冈底斯山西麓，流经印度，经巴基斯坦后注入阿拉伯海（支流覆盖部分阿富汗）。根据联合国粮食及农业组织（FAO）的数据，印度河流域面积总共覆盖112万平方公里的土地，巴基斯坦占其中47%，印度占39%，中国只有8%，阿富汗占6%。所以，有关印度河水资源使用的争议，主要是在印度和巴基斯坦之间展开的。
1947年印巴分治时，印度曾一度切断供应下游巴基斯坦旁遮普省运河的水源，造成巴基斯坦农业受损，居民生活受到威胁。1949年的印巴战争后，双方在克什米尔的分界线基本上按照实际控制线而固定了下来，印度河下游的广大流域都划入了巴基斯坦，而上游的主干道和主要支流都在印控的克什米尔境内。两国为水资源归属问题不断争吵，巴基斯坦意识到，印度可以随时切断上游水流或人工修改河道，从而造成巴基斯坦的水资源短缺。面对这一国家战略性问题，巴基斯坦曾一度寻求上诉国际仲裁机构，但印度以“双边问题应由双边谈判”为由拒绝。
经过十几年的讨价还价，在世界银行等国际机构的帮助下，印巴两国终于在1960年签署了《印度河用水条约》（Indus Waters Treaty），条约就河水资源使用、水利开发、争端解决机制等方面做了详细的规定，其主要内容就是规范了在印度河干流和上游五条主要支流（共六条）中，西部三条河流归巴基斯坦使用，东部三条归印度。
争端升级
《印度河用水条约》自诞生以来，印巴双方基本上能够遵守条约的规定，经历了克什米尔地区大大小小十多次武装冲突和外交冷战，印巴两国都没有将领土争端延伸到破坏水资源共享的程度。
然而，随着经济的发展，印度对水的需求量上升，印度政府也渐渐在水利规划等项目中，放松对条约的恪守程度。宏大的灌溉计划使得印度不仅在东部三条河的上游建设了众多水电站，还在西部归属巴基斯坦的支流上建造了电站。尽管印度对外声称，西部支流上的电站是径流式水电站，不影响下游水量，但巴基斯坦一直对此耿耿于怀。
同时，巴基斯坦为了发展国内经济，也希望能够最大限度地开发印度河上游属于自己的水利资源。进入21世纪后，巴基斯坦规划了几座位于印度河上游的水电站项目，均遭到印度以各种借口进行的反对，一些项目由于印度的干扰、没能得到国际金融机构的融资而搁置。
去年9月，印巴在克什米尔地区的冲突不断升级，印度总理莫迪扬言，将考虑通过控制印度河上游水量对巴基斯坦进行报复。印度政府暂停了持续几十年的、由印巴双方共同参与的印度河水资源管委会年会，并威胁要重新审议、甚至废除《印度河用水条约》。
作为回应，巴基斯坦外交事务顾问阿齐兹（Sartaj Aziz）表示，印度如果废除《印度河用水条约》的话，巴基斯坦将会把这种行为看作是一种“战争行为”（Act of War），“或者是对抗巴基斯坦的敌意行为”。至此，一些观察家认为，印巴之间的冲突即将升级为另一种形式的战争 —— 水资源战争（Water War）。
中国介入水资源战争
就在印度政府表示要重新审议《印度河用水条约》后不久，中国宣布在西藏境内雅鲁藏布江上游的一个支流夏布曲上进行暂时断流。尽管中国方面声称，这一举动是中国规划已久的拉洛水利枢纽工程的必要步骤，而且夏布曲支流的断流并不影响雅鲁藏布江进入下游国家的水量，印度和巴基斯坦的媒体还是对此作出了激烈的反应。跟巴基斯坦媒体的欢欣鼓舞正相反，印度媒体一片担忧。《印度斯坦时报》（The Hindustan Times）就曾表示，中国这是在警告印度，不要以截流印度河水的方式来报复巴基斯坦。
雅鲁藏布江是中国、印度、孟加拉国的共享河流，三国之间虽然没有一个《用水条约》，但多年来经协商产生了一个水资源分配的对话机制，任何修建水利工程的事情都需要三方协商才能实施。夏布曲是雅鲁藏布江的支流，其全长185公里水流都在中国境内，因此，在夏布曲上修建水电站不需要与他国协商。
中国在雅鲁藏布江干流上修建的樟木水电站已经于2015年投入使用，尽管中方表明该水电站是一个径流式电站，不影响下游水量，但印度在该水电站建造过程中曾多次表达过“关切”和“担忧”。另外，中国在雅鲁藏布江支流上还有三座计划中的水电站，由于夏布曲的断流工程，上述水电站在印度国内引起了恐慌。《第一邮报》在报道中指出，印度的水利专家们敦促印度政府，尽快与雅鲁藏布江流域国家协商一份《用水条约》，以保障印度东北部地区不受水源枯竭的威胁。
分析人士认为，中国不会因印度的“担忧”而停止在巴控克什米尔修建水利项目，印度利用上游优势威胁巴基斯坦民生攸关的水资源，而巴基斯坦的“铁哥们”中国利用更上游的优势警告印度，实为地缘博弈的升级表现。美国史汀生中心（Henry L. Stimson Center）的客座研究员法兹尔（Muhammad Daim Fazil）在《外交学人》（The Diplomat）上撰文指出：“（印度）废除《印度河用水条约》将危及地区安全……可能会最终导致涉及三方的更大规模的战争危机。”
