3月27日，格尔登寺32岁的僧人洛桑金巴留下遗书后，在僧舍用绳子上吊自杀。他在遗书上说当局指控格尔登寺的罪名（领导和组织抗议活动；保存被中国军警枪杀的尸体；对外界透露消息）都由他一人承担，与寺院和其它僧人无关；并且声明是他率领了和平抗议，他为此负责。遗书最后写：“我不希望生活在中国的压迫下，不要说一天，甚至一分钟也不愿意”，然后是他的签名。

3月28日，中午十二时，全副武装的中共军警闯入格尔登寺，三、四个公安人员和一个全副武装的武警为一组，搜查所有僧舍，毁损达赖喇嘛照片等，并闯入护法神殿没收放在殿内的枪支刀具等，这本是以狩猎为生或在“草场纠纷”的械斗中使用过武器的藏人，出于信仰和忏悔将武器送到护法神殿，为的是表示从此不再杀生、不再动用暴力的意愿，但却成了僧侣从事暴力活动的证据。至29日，格尔登寺有500多名僧人被抓走。

4月3日，阿坝州副州长肖友才对媒体承认“值勤民警依法使用武器”，但否认军警开枪打死藏人，说“目前没有发现死伤者”，有受伤者皆已“逃窜”。并称流传出去的藏人被枪杀照片或是伪造。并称警方在格尔登寺查获了一批武器弹药，凭此作为僧侣从事暴力活动的证据。

4月16日，格尔登寺29岁的僧人图松自杀。他是一位盲人，自杀前他对家人说：这样的日子不要说有眼睛的你们受不了，连我这个瞎了眼的人也受不了。

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图为阿坝格尔登寺的转经道上，凡有达赖喇嘛画像皆被毁损。